入门指南

August 15, 2026 · View on GitHub

这是什么

dsh-scientific 是 DeepSeek Harness（DSH）的科研计算插件套件：文献管理、分子对接、结构可视化、分子动力学，配套研究 skills 与工作流。

Zotero 插件已独立成仓库（Hongcheng-LI/dsh-zotero），不再位于本仓库 plugins/ 下；本仓库的 skills/workflows 引用 zotero_* 工具时需先单独安装该插件。

环境要求

  • Node.js ≥ 20
  • DSH（DeepSeek Harness）已安装
  • 按需：Zotero 7+（zotero 插件）、Vina/PyMOL/ChimeraX/GROMACS（计算插件，见各自 README）

安装插件

Zotero 插件（独立仓库，一行装）

dsh plugin --profile web add github:Hongcheng-LI/dsh-zotero

装好后重启 dsh web。

本仓库的骨架插件（vina/pymol/chimerax/gromacs）

本仓库是 monorepo，根目录不是插件包，按插件目录打包安装：

git clone https://github.com/Hongcheng-LI/dsh-scientific
cd dsh-scientific && npm install && npm run build
cd plugins/<name> && npm pack
dsh plugin --profile web add ./<name>-*.tgz

骨架插件目前不注册工具，安装无副作用。

安装 skills

DSH 从技能目录发现 skills（<name>/SKILL.md）。把本仓库 skills/ 下需要的目录复制（或符号链接）到你的 DSH 用户技能目录，或在项目根放置。确认方式：会话中问 agent "有哪些可用 skills"。

使用

  • 文献：让 agent "在我的 Zotero 里搜 XXX"（zotero 插件工具）
  • 方法论：说"帮我做 XXX 的文献综述"会触发 literature-review skill
  • 全流程：按 workflows/ 的手册逐段执行

开发

git clone https://github.com/Hongcheng-LI/dsh-scientific
cd dsh-scientific
npm install
npm run build   # 构建全部插件
npm test        # 运行全部测试

新插件开发见 plugin-development.md，新 skill 见 skill-development.md。