Option 1: Download the Module from GitHub

Step 1: Choose the module you want to study. Example: Modulo01

Note: It’s normal to see the message Unable to render code block in Module 01 due to the large number of embedded images.

Step 2: Click on Raw to download the notebook file. You’ll get a file named Modulo01_IntrocucaoNotebooks_e_BancosdeDados.ipynb.

Step 3: Go to Google Colab[https://colab.research.google.com/]

Step 4: Click on File → Upload notebook

Step 5: Select the downloaded .ipynb file

Done! You can now run and edit the notebook in Colab.

Option 2: Clone the GitHub Repository

Step 1: On GitHub, click the green Code button

Step 2: Select HTTPS and copy the link: https://github.com/integrativebioinformatics/SingleCell-Notebooks.git

Step 3: Go to Google Colab

Step 4: Click on File → Open notebook

Step 5: In the pop-up window, go to the GitHub tab and paste the link: https://github.com/integrativebioinformatics/SingleCell-Notebooks.git

Step 6: Click Search and open the notebook you want

If the repository doesn’t load directly, search for SingleCell-Notebooks in the GitHub tab and browse the available notebooks manually.

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Como Fazer Upload de Notebooks no Google Colab

Opção 1: Baixar o Módulo Diretamente do GitHub

Passo 1: Escolha o módulo que deseja estudar. Exemplo: Modulo01

Atenção: É normal aparecer a mensagem Unable to render code block nesse módulo por causa da quantidade de imagens.

Passo 2: Clique em Raw para baixar o arquivo bruto. Você vai obter um arquivo com extensão .ipynb.

Passo 3: Acesse o Google Colab[https://colab.research.google.com/]

Passo 4: Clique em Arquivo → Fazer upload de notebook

Passo 5: Selecione o arquivo .ipynb que você baixou

Pronto! Agora você pode visualizar, editar e executar o notebook diretamente no Colab.

Opção 2: Clonar o Repositório do GitHub

Passo 1: No GitHub, clique no botão verde Code

Passo 2: Selecione a opção HTTPS e copie o link: https://github.com/integrativebioinformatics/SingleCell-Notebooks.git

Passo 3: Acesse o Google Colab

Passo 4: Clique em Arquivo → Abrir notebook

Passo 5: Na janela que abrir, vá até a aba GitHub e cole o link copiado

Passo 6: Clique em Pesquisar e selecione o notebook que deseja abrir

Se o repositório não aparecer diretamente, digite SingleCell-Notebooks na barra de busca da aba GitHub e explore os notebooks disponíveis.

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Cómo Subir Notebooks en Google Colab

Opción 1: Descargar el Módulo desde GitHub

Paso 1: Elige el módulo que deseas estudiar. Ejemplo: Modulo01

Nota: Es normal que aparezca el mensaje Unable to render code block en este módulo debido a la cantidad de imágenes.

Paso 2: Haz clic en Raw para descargar el archivo original. Obtendrás un archivo con extensión .ipynb.

Paso 3: Accede a Google Colab[https://colab.research.google.com/]

Paso 4: Haz clic en Archivo → Subir notebook

Paso 5: Selecciona el archivo .ipynb que descargaste

¡Listo! Ya puedes visualizar, editar y ejecutar el notebook directamente en Colab.

Opción 2: Clonar el Repositorio de GitHub

Paso 1: En GitHub, haz clic en el botón verde Code

Paso 2: Selecciona la opción HTTPS y copia el enlace: https://github.com/integrativebioinformatics/SingleCell-Notebooks.git

Paso 3: Accede a Google Colab[https://colab.research.google.com/]

Paso 4: Haz clic en Archivo → Abrir notebook

Paso 5: En la ventana emergente, ve a la pestaña GitHub y pega el enlace copiado

Paso 6: Haz clic en Buscar y abre el notebook que desees

Si el repositorio no aparece directamente, escribe SingleCell-Notebooks en la barra de búsqueda de la pestaña GitHub y explora los notebooks disponibles.