README.md

June 24, 2015 · View on GitHub

Приложения к книге "Статистический анализ и визуализация данных с помощью R"

Этот репозиторий содержит файлы скриптов на языке R и наборы данных, необходимые для воспроизведения примеров из книги Мастицкий С.Э., Шитиков В.К. "Статистический анализ и визуализация данных с помощью R". Данное пособие обобщает серию методических статей по R, опубликованных в блоге "R: Анализ и визуализация данных", а также включает несколько специально написанных дополнительных разделов. Впервые книга была опубликована в декабре 2014 г. в электронном виде в рамках лицензии Creative Commons "Атрибуция - Некоммерческое использование - На тех же условиях 4.0 Всемирная". Летом 2015 г. в издательстве "ДМК Пресс" (Москва) вышла также печатная версия этой книги, с исправлениями и новыми дополнениями. Опубликованная ранее электронная версия по-прежнему будет распространяться бесплатно, однако какое-либо дальнейшее ее радактирование не планируется.

Репозиторий разбит на две директории в соответствии с годом издания книги - Edition_2014 и Edition_2015. Обе эти директории имеют следующую одинаковую структуру (хотя содержание отдельных файлов в них несколько различается):

  • В папке Book хранится PDF-файл книги (для издания 2015 г. доступен только файл с содержанием, предисловием и частью 1-й главы).
  • Папка Scripts включает скрипты с примерами кода. Каждый скрипт соответствует одной из 9 глав. Имена этих файлов состоят из Ch_ (от chapter - "глава") и порядкового номера главы (например, Ch_1.R). Кроме того, в этой папке хранится скрипт Kendall_Theil_Regr.R, код в котором определяет функцию для выполнения регрессионного анализа по методу Кендалла-Тейла.
  • Папка Data содержит наборы данных, используемых в книге. В частности, в ней представлены следующие файлы:
ФайлОписание
sleep_imp.RdataСон животных: набор данных sleep из пакета VIM после заполнения пропусков
wader.txtПример из работы Zuur et al. (2010) по двум видам птиц
SparrowsElphick.txtПример из работы Zuur et al. (2010) по воробьям
55.45N-36.85E-TAVG-Trend.txtСреднемесячные температуры в Москве (оригинал Berkeley Earth)
TAVG_Moscow.txtСреднемесячные температуры в Москве (преобразованные данные, 3 столбца)
TAVG_Moscow.RDataСреднемесячные температуры в Москве (данные в матричной форме)
Гадюки.txtДанные по смертности мышей при введении яда гадюки
dreissena_infection.txtДанные по зараженности моллюска Dreissena (сгруппированные)
dreissena_infection_raw_data.txtДанные по зараженности моллюска Dreissena (исходные)
Elton_TolInt.txtСоленость воды и численность видов бентоса в реках Приэльтонья
RIKZ.txtДанные по морским животным из книги Zuur et al. (2009)
maps.yandex.ru.JPGКарта для нанесения местообитаний гадюк
13.txtДанные Н.Чижиковой для анализа пространственного расположения растений

С вопросами и предложениями по поводу содержания этого репозитория обращайтесь, пожалуйста, по электронной почте.